Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui perkembangan Non Performing Financing (NPF) Murabahah, Musyarakah, Return On Asset (ROA) dan untuk mengetahui pengaruh Non Performing Financing (NPF) Murabahah dan Musyarakah Terhadap Return On Asset (ROA) pada PT. Bank Mega Syariah. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif dan metode verifikatif. Data yang digunakan dalam penelitian ini diperoleh dari data Laporan Keuangan Tahunan PT. Bank Mega Syariah periode 2009-2013. Analisa data yang digunakan dalam penelitian ini yaitu pengujian asumsi klasik (uji normalitas, uji multikolonieritas, uji heterokedastisitas, dan uji autokorelasi), persamaan regresi linier berganda, koefisien korelasi, koefisien determinasi, uji t (uji parsial) dan uji F (uji simultan). Hasil penelitian ini memiliki persamaan regresi linier bergandaY= 0,819 - 0,429 X1+ 0,222X2, nilai korelasi sebesar 98,1% yang menunjukkan hubungan yang sangat kuat antara NPF Murabahah dan NPF Musyarakah Terhadap ROA. NPF Murabahah tidak berpengaruh signifikan terhadap ROA secara parsial. Serta NPF Musyarakah berpengaruh positif dan signifikan terhadap ROA secara parsial. NPFMurabahah dan NPF Musyarakah mempengaruhi ROA secara simultan sebesar 96,3 % sedangkan sisanya sebesar 3,7% dipengaruhi oleh faktor lain yang tidak diteliti.