Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh penerapan sistem informasi akuntansi dan kinerja karyawan terhadap kinerja organisasi. Tiga variabel yang diteliti pengaruh penerapan sistem informasi akuntansi dan kinerja karyawan sebagai variabel independen serta kinerja organisasi sebagai variabel dependen. Penelitian ini dilakukan pada Koperasi Karyawan Jasa Marga Bhakti VI. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif dan verifikatif. Data yang digunakan berasal dari data primer. Teknik pengambilan sampel yang digunakan adalah cluster random sampling. Berdasarkan pengujian hipotesis, dapat disimpulkan bahwa secara parsial penerapan sistem informasi akuntansi dan kinerja karyawan berpengaruh terhadap kinerja organisasi. Sedangkan, hasil uji F menyatakan bahwa secara bersama-sama penerapan sistem informasi akuntansi dan kinerja karyawan berpengaruh terhadap kinerja organisasi.